İnsanlığın kurduğu On İki Koloni, Cylonların ani nükleer saldırısıyla yok olmanın eşiğine gelir. Az sayıdaki kurtulan, eski savaş gemisi Galactica ve sivil gemilerden oluşan bir filoyla uzaya kaçar. Edward James Olmos’un William Adama’sı filonun güvenliğini sağlarken, Laura Roslin yeni bir yönetim kurmaya çalışır. Son umutları, efsanelerde geçen Dünya’yı bulmaktır. Fakat Cylonlar filoyu adım adım izliyor ve insan görünümündeki ajanları hayatta kalanların arasına sızıyor. Lee Adama ve Kara Thrace yaklaşan saldırılara karşı savaşırken, Gaius Baltar geçmişte yaptığı hataların sonuçlarını gizlemeye uğraşır. Erzak azalır, siyasi anlaşmazlıklar büyür ve her yeni karar filodaki yaşamı doğrudan etkiliyor. İnsanlar, peşlerindeki düşmandan kaçarken kime güvenebileceklerini de sorgular.