Karanlık Arzu, evli bir kadının kısa süreli kaçamağının ardından yakın çevresindeki insanlardan kuşkulanmasını konu almaktadır. Alma Solares, ailesinden uzakta geçirdiği bir hafta sonunda genç Darío Guerra ile tutkulu bir ilişki yaşamaktadır. Eve döndüğünde bu buluşmayı geride bırakmak istemektedir. Ancak yaşanan bir ölüm, Alma’nın kararlarını ve çevresindeki kişileri sorgulamasına neden olmaktadır. Alma’ya hayat veren Maite Perroni, gerçeği öğrenmek için olayların izini süren bir kadına hayat vermektedir. Darío’ya hayat veren Alejandro Speitzer ise Alma’nın hayatından çıkmayan genç adam olarak öne çıkmaktadır. Alma’nın eşi Leonardo ve kardeşi Esteban da soruşturmanın içinde yer almaktadır. Zoe ise annesinin davranışlarındaki değişimi fark etmektedir. Alma, kaçamağıyla ölüm arasındaki bağlantıyı araştırdıkça ailesine dair rahatsız edici bilgilere ulaşmaktadır.