Under the Banner of Heaven, Utah’ta işlenen vahşi bir cinayeti soruştururken kendi inancını da sorgulamaya başlayan Jeb Pyre’ın hikayesini anlatıyor. Jeb Pyre, Brenda ile küçük kızının öldürülmesini araştırmak için göreve gidiyor. İzler onu Ron, Dan ve Dianna’nın da içinde olduğu Lafferty ailesine götürüyor. Ailenin katı dini görüşleri, devlete duydukları öfke ve ev içindeki baskı, soruşturmayı daha da ağırlaştırıyor. Brenda’nın bu aileye gelin olarak girdiğinde yaşadıkları yavaş yavaş ortaya çıkıyor. Jeb Pyre, tanıklarla konuşuyor, eski kayıtları inceliyor ve cinayetin tek bir öfke patlaması olmadığını anlıyor. Topladığı her bilgi, onu hem aile içindeki bağlara hem de kendi inancında cevap veremediği sorulara yaklaştırıyor.