Zankyô no teroru'da, Tokyo'da meydana gelen büyük bir patlamanın ardından halk korkuya kapılmaktadır. Nine ve Twelve, internette yayımladıkları şifreli videolarla yeni saldırıların haberini vermektedir. Kendilerine Sfenks adını veren ikili, polise çözülmesi gereken bilmeceler bırakmaktadır. Eski dedektif Shibazaki, ipuçlarını takip ederek saldırıların ardındaki amacı anlamaya çalışmaktadır. Lisa ise okulda ve evde yaşadığı sorunlardan kaçarken Nine ve Twelve ile karşılaşmıştır. Genç kız, istemeden onların tehlikeli planlarına dahil olmaktadır. Polis her yeni bilmece için zamanla yarışmaktadır. Shibazaki araştırmasını derinleştirdikçe Nine ve Twelve'in geçmişine uzanan izler bulmaktadır. Seslendirme kadrosunda Soma Saito, Atsumi Tanezaki, Kaito Ishikawa, Shunsuke Sakuya ve Yoshimitsu Shimoyama yer almaktadır.