Atlas Shepherd, karmaşık veri kümelerini inceleyen yetenekli bir veri analistidir. Bir gün kendisine, isyan eden bir robotu durdurma görevi verilir. Atlas, bu robot Harlan ile geçmişte bir kez karşılaştığını hatırlar. Görev onu beklediği gibi ilerletmez ve kısa sürede kontrol elinden kayar. İnsanlığın geleceği tehlikeye girer. Atlas, bu sırada yalnız hareket etmek yerine yapay zekâ ile iş birliği kurmayı öğrenir. Veriyi okuma becerisi ve hızlı kararlarıyla Harlan’ın peşine düşer. Colonel Elias Banks de operasyonu yönetir, Smith ve Casca Decius ise bu kovalamacada öne çıkan isimler olur. Atlas, hem geçmişini hem de karşısındaki tehdidi çözmeye çalışırken hayatta kalmak için aklını sonuna kadar kullanır.