Kafesteki Kadın'te, Carl başarısız bir soruşturmanın ardından başka bir birime gönderilir. Ama o, masa başında kalmaz ve beş yıl önce intihar ettiği sanılan Merete Lynggaard dosyasını yeniden açar. Hafez el-Assad ile birlikte eski kayıtları inceler, yasak olmasına rağmen dosyalara ulaşır ve yeni izler bulur. Araştırma ilerledikçe Merete’nin ölümünün intihar olmadığını anlar. Carl, Marcus Jacobsen’in baskısı altında çalışırken Uffe Lynggaard ve çevresindeki bağlantıları da tek tek izler. Her yeni adımda dava daha da karmaşıklaşır ve Carl, Merete’ye ne olduğunu ortaya çıkarmak için peş peşe ipuçlarını birleştirir.