Zatoichi'te, kör kılıç ustası Zatoichi bir dağ kasabasına gelir ve geçimini kumar ile masaj yaparak sağlar. Kasabada Ginzo çetesinin baskısı hemen dikkatini çeker. Çete, kasabayı zorla yönetir ve karşı çıkanları öldürür. Hattori, bu cinayetlerde baş roldedir. Zatoichi, arkadaşı Shinkichi ile birlikte iki geyşe kardeşle tanışır. İki kardeş, ailelerinin intikamı için kasabadadır. Zatoichi, onların izini sürerken çeteyle yüzleşir. Kılıcını hızla kullanır ve adamları birer birer alt etmeye başlar. Kasabada kanlı bir hesaplaşma giderek yakınlaşır.