Elizabeth Shaw, antik bir yıldız haritasının izini süren bir arkeologdur. 2089 yılında İskoçya’da Charlie Holloway ile birlikte bulduğu işaretlerin LV-223 adlı bir gezegeni gösterdiğini fark eder. Peter Weyland, bu ipucu üzerine bir keşif yolculuğunu finanse eder ve ekip uzak gezegene ulaşır. Orada Dünya’ya benzeyen ama yaşama elverişsiz görünen bir ortamla karşılaşırlar. Araştırma sırasında insanlara dair izler ve mühendis olarak adlandırdıkları varlıklara ait kalıntılar bulunur. Gemideki bir olay sonrası Charlie hastalanır, Elizabeth ise hamile olduğunu öğrenir. Meredith Vickers, ekibin güvenliğini korumaya çalışırken gerginlik gemi içinde büyümektedir.